Côn trùng:
- Giòi hành tây (Delia antiqua)
- Bọ trĩ (Thrips tabaci)
- Ruồi hành (Eumerus spp.)
- Giun đũa (Agrotis spp.)
- Rệp (Aphis spp.)
nấm:
- Bệnh thối trắng (Sclerotium epivorum)
- Bệnh sương mai (Kẻ hủy diệt Peronospora)
- Rễ hồng (Phoma terrestris)
- Bệnh thối gốc Fusarium (Fusarium oxysporum f. sp. cepae)
Virus:
- Virus lùn vàng hành tây (OYDV)
- Virus đốm vàng mống mắt (IYSV)
- Virus khảm hành (OMV)
- Virus gây bệnh thuốc lá (TRV)
Các loài gây hại khác:
- Tuyến trùng (Ditylenchus dipsaci)
- Ve củ (Rhizoglyphus spp.)
- Động vật gặm nhấm (chẳng hạn như chuột đồng và chuột)
Điều đáng chú ý là mức độ nghiêm trọng và tác động của các loài gây hại này có thể khác nhau tùy thuộc vào khu vực và khí hậu cụ thể cũng như các phương pháp canh tác được sử dụng.